деструкторами органических веществ являются гетеротрофные бактерии,
способные разрушать и усваивать разнообразные органические соединения.
С помощью бактерий в верхних слоях водоема, более богатых
кислородом, происходит аэробное окисление органических загрязнений, а
также хемосинтез (нитрификация, окисление сероводорода). Вблизи дна и в
донных 
отложениях 
идёт 
анаэробный 
распад 
органических 
веществ,
приводящий к образованию различных продуктов неполного окисления,
метана, сероводорода.
Организмы — зоопланктона 
участвуют 
в 
процессах 
деструкции
органических веществ, питаясь фитопланктоном и бактериями. Фильтраторы
и седиментаторы зоопланктона (рачки, коловратки, простейшие) вносят
основной 
вклад 
в 
осветление воды, 
снижая 
численность 
бактерий 
и
водорослей на 90 — 99 %.
Бактерии и зоопланктон активно потребляют кислород. Поступление
кислорода в водоём происходит путём массопередачи из воздуха и за счёт
выделения при фотосинтезе.
Фитопланктон не только обогащает воду кислородом, необходимым
для аэробной деструкции органических веществ, но и является основнымМ
потребителем биогенных элементов.
Чрезмерное развитие фитопланктона, вызванное избытком биогенных
элементов, приводит к вторичному загрязнению водоемов. Образующиеся
при разложении организмов фитопланктона легкоокисляемые органические
вещества — (растворимые 
продукты — деструкции 
углеводов 
и 
белков)
загрязняют преимущественно толщу воды, а более трудноокисляемые, в
частности клетчатка, опускаются на дно, где участвуют в образовании
стойких лигниногумусовых комплексов и способствуют заилению водоёмов.
Предотвращение вторичного загрязнения может быть достигнуто удалением
избытка фитопланктона или созданием условий, при которых вся первичная
продукция бУДСТ утилизироваться водными организмами.