Подземные воды В геоструктурном отношении бассейн р. Сырдарья находиться в Сырдарьинском сложном артезианском бассейне. Глубина залегания фундамента в прогибах достигает более 1500 м, а на участках поднятий и валов до 600 м. Гидрогеологической особенностью территории является наличие двух гидрогеологических ярусов, разделенных между собой толщей эоцен- олигоценовых глин мощностью более 100 м. Верхний ярус объединяет водоносные горизонты четвертичных и неогеновых отложений. К нижнему гидрогеологическому ярусу приурочены многослойные, этажно расположенные напорные воды верхнего и нижнего мела. Геологические и гидрогеологические условия бассейна обусловили формирование в его пределах болышого количества пресных и слабосолоноватых вод.