В структуре водопользования доля орошаемого земледелия в Шу-Таласском бассейне составляет 35-40%, что почти в 1,52 раза меньыше, чем в Балхаш- Алакольском и Арало-Сырдарьинском — бассейнах, где этот — показатель соответственно равен 70-75% и 60-65%. Показатель удельного использования воды, на 1 га орошаемой площади больше всех в Кызылординской области - 20000-25000 м`/га (где возделываются в основном — культуры рисового севооборота). В Шу-Таласском и Балхаш- Алакольском бассейне эта величина составляет 3500-5000 м“/га. Орошаемое земледелие, располагаясь в бассейнах рек, по объемам отведения загрязненных коллекторно-дренажных и сбросных вод с оросительных систем является одним из основных источников загрязнения поверхностных вод. В Балхаш-Алакольском бассейне орошаемое земледелие в основном расположено в бассейнах рек Иле, Каратал, Чарын. По сравнению с 1990 г. объем отводимых коллекторно-дренажных вод (в основном в р. Иле) сократился почти в 5 раз - с 560,28 млн. м’/год до 110,115 млн. м`/год, тогда как объем отводимых сточных вод остался примерно на том же уровне. Коллекторно-дренажные воды в основном формируются в Балхашской и Каратальской водохозяйственных системах и в настоящее время ежегодно в объеме 150-200 млн.м° отводятся с высоким содержанием органических, азотосодержащих и взвешенных веществ в р. Иле и р. Каратал. В бассейне р. Сырдарьи в настоящее время имеется в наличии 732 тыс. га, из которых используется 608 тыс.га. Объем возвратных вод с орошаемых массивов составляет 2842 млн. м’, из них сбрасываются в р. Сырдарью 1485 млн. м’, остальной объем - в озерные системы и притоки.