Специально уполномоченные органы, регулирующие качество вод в СНГ. В странах СНГ государственное управление водохозяйственным комплексом осуществляют Правительство, уполномоченные государственные органы управления использованием и охраной водного фонда, местные представительные и исполнительные органы. Уполномоченные органы представлены республиканскими структурами по охране природы, по управлению и охране вод, как самостоятельными, так и в составе различных министерств и ведомств, органами санитарного контроля и бывшими республиканскими структурами Поскомпидромета Советского Союза.