Во времена Ю.В. Андропова, Москва четко заявила о поддержке
проекта, и даже будущий глава государства, в то время секретарь ЦК КПСС
по 
сельскому 
хозяйству, 
М.С. 
Горбачев 
на 
совещании 
в 
институте
«Гипроводхоз», где в феврале 1985 года докладывался этот проект, заявил:
«Этот проект крайне необходим с политической точки зрения. «Рулевое
колесо» Средней Азии всегда будет в руках России».
Вместе с тем, разработка проекта проходила в довольно сложных
условиях, с пробуксовками из-за конфликтов интересов и зарождающихся
сомнений в правомерности тех или иных решений. Наступивший период
«грандиозных похорон» постоянная смена власти в Кремле не могла не
отразиться на ходе реализации проекта.
В средствах массовой информации развернулась протестная кампания
литераторов и некоторых ученых, в основном, далеких от проблем водного
хозяйства 
и 
охраны 
окружающей 
среды. 
Искажая 
цифры 
и 
факты,
противники проекта, опережая друг друга, ринулись опошлять проект под
лозунгом «антиприродная гигантомания». В целом, 
в 
последние годы
существования СССР, водное хозяйство представлялась в виде монстра,
подмявшего под себя всю государственную систему и проглатывающего
миллиарды кубометров воды, миллиарды рублей, способного истребить
природу, 
врагом 
народа 
«номер 
один» 
и 
главным — растратчиком
государственных средств.
Ситуация 
в 
стране 
также 
усиливала 
противодействие 
проекту
перераспределения стока сибирских рек.
При М.С. Горбачеве страна быстрыми темпами теряла управляемость.
В 
80х годах значительно 
уменьшились 
финансовые 
и 
экономические
возможности. 
Все 
аргументы 
ведущих 
экономистов 
того 
времени, 
в
отношении 
недостаточной 
проработки 
социально-экономического
обоснования проекта были не более чем попыткой оправдать отсутствие
необходимых финансов в стране. Более того, раскрываемое тогда «узбекское
хлопковое дело» дало повод для роста антисреднеазатских настроений.
Именно в этом контексте следует рассматривать принятое в августе
1986 года правительством СССР постановление «О прекращении работ по
перераспределению 
стока 
рек 
в 
Среднюю 
Азию». 
Согласно 
этому
постановлению, в помощь республикам Средней Азии и Казахстану Госплан
СССР, 
совместно 
с 
— Академией 
— наук, 
ГКНТ 
и 
Академией
сельскохозяйственных наук должны были разработать стратегию социально-
экономического развития и восстановления окружающей среды в регионе за
счет собственных водных ресурсов. 
Однако это решение 
было лишь
«извинением», так как в 1988 году Госплан СССР передал этот вопрос
Министерству водных ресурсов, которое в то время уже «дышало на ладан».
Стратегия была подготовлена к концу 1989 года, но никто не рассматривал её