С течением времени, компетенция совместных органов стала намного шире за счет
новых сфер деятельности и растущих полномочий экологического характера. Функции
и задачи совместных органов стали всеобъемлющими и разнообразными для того,
чтобы сделать возможным применение бассейнового подхода и принципов ИУВР
совместными органами и прибрежными государствами. Среди функций совместных
органов 
можно 
выделить: 
(а) 
координационно-совещательную 
функцию; 
(Ъ)
исполнительную функцию; и (с) функцию контроля за выполнением соглашения и
урегулирования споров. Функции совместных органов конкретизируются в задачах,
возлагаемых на них в соответствующих соглашениях. Конвенция по трансграничным
водам содержит минимальный перечень задач, которыми должны быть наделены
совместные органы, создаваемые 
в соответствии с конвенцией. На практике, в
компетенцию целого ряда конкретных совместных органов включены также многие
дополнительные задачи.
Наиболее 
очевидным — признаком, 
по 
которому — отличаются 
— между — собой
Уполномоченные и — совместные комиссии, является организационная структура.
Организационная структура института Уполномоченных достаточно проста, в то время
как 
совместные комиссии обычно обладают более разветвленной организационной
структурой. Совместные комиссии чаще всего имеют орган или органы, принимающие
решения, исполнительные органы и рабочие или вспомогательные органы. Элементами
организационной 
структуры 
совместных 
комиссий 
могут 
быть, 
в 
частности,
конференция Сторон соглашения, пленарное заседание комиссии, делегации Сторон,
орган на уровне глав делегаций, председатель комиссии, секретариат, рабочие группы,
группы — экспертов, 
аудиторская 
комиссия, 
консультативная 
группа — доноров,
информационный 
центр, 
центр 
по 
подготовке кадров, 
национальные 
отделения
совместного органа и наблюдатели. Несмотря на многообразие организационных
структур 
совместных 
комиссий, 
важно, 
чтобы 
помимо 
органов, 
принимающих
решения, у комиссий были еще и исполнительные и рабочие органы для обеспечения
непрерывности 
и 
последовательности 
деятельности 
и 
выполнения 
принимаемых
решений.
Совместные комиссии в Европе и по всему миру накопили большой опыт и выработали
передовые 
методы 
в 
области институциональных 
аспектов 
создания 
и работы
совместных органов. Это, в частности, касается правил процедуры, принципов и
процедур 
принятия 
решений, 
вопросов 
— функционирования — секретариата 
и
регулирования правосубъектности. Совместные комиссии выработали механизмы по
обеспечению участия общественности, такие как статус наблюдателя, рабочие группы
по 
сотрудничеству 
с 
неправительственными 
организациями 
(НПО) 
и 
другими
заинтересованными сторонами, конференции заинтересованных сторон и др.
Разработан целый ряд финансовых механизмов для финансирования не только затрат
по проведению совещаний и повседневному мониторингу, но и деятельности по
выполнению 
совместных программ и 
поддержанию 
организационных механизмов
совместных органов, включая расходы на функционирование секретариата. При том,
что вклады Сторон обычно являются основным источником бюджета, некоторые
совместные комиссии практикуют создание резервных фондов, ведение партнерства с
частным сектором, привлечение донорской поддержки или учреждение финансовых
фондов.
Разработан ЦСЛЫЙ ряд механизмов по обеспечению сотрудничества между речными и
морскими комиссиями, а также между речными комиссиями, ДСЙСТВУЮЩИМИ в рамках