Исполком располагается в той стране, Глава которой является Президентом Фонда. Исполком обеспечивает свою деятельность в соответствии с Положением об Исполкоме, Регламентом (порядком) работы Правления Фонда, подотчетен Президенту и Правлению Фонда. Председатель Исполкома по согласованию с Президентом Фонда определяет порядок и размер заработной платы штатных сотрудников, условий контрактов по найму исполнителей проектов и программ в пределах сметы, утверждаемой Правлением. Дальновидная линия на сохранение сотрудничества стран Центральной Азии по совместному использованию водных ресурсов рек Амударья и Сырдарья, закрепленная сначала в «Соглашении между странами Центральной Азии о сотрудничестве в сфере совместного управления использованием и охраной водных ресурсов межгосударственных источников», подписанное руководителями водохозяйственных ведомств стран региона 18 февраля 1992 г. в г.Алматы. МКВК состоит из лиц, уполномоченных Правительствами, на которых возложено решение вопросов управления водными ресурсами. Создание МКВК стран Центральной Азии, встречи руководителей водохозяйственных ведомств на регулярной основе в рамках указанной комиссии по рассмотрению вопросов регулирования водохозяйственных отношений на межгосударственных водных источниках и на водохозяйственных объектах межгосударственного и приграничного характера, позволили за истекший период обеспечить слаженное взаимодействие органов управления водным хозяйством стран региона. Поэтому сотрудничество на основе принципа взаимного уважения и с учетом общепризнанных норм и принципов международного права по управлению и использованию трансграничными реками имеет большое значение для стран - Центральной Азии. Один из механизмов — осуществления сотрудничества является МКВК. Секретарь МКВК, директор НИЦ МКВК и начальники БВО участвуют в заседаниях без права голоса. Комиссия может принять решение по приглашению наблюдателей или консультантов для участия в ее заседаниях. Но несмотря на возникающие трудности МКВК и её организации своей деятельностью, решением возникающих вопросов доказали о необходимости и важности наличия между Центрально-Азиатскими странами этого органа. Кроме этого, регулярно проводится встречи между представителями водохозяйственных организации Туркменистана с Республикой Узбекистан, Техническое совещание представителей водохозяйственных — организации Туркменистана, Республики Узбекистан и БВО «Амударья» для распределения водных ресурсов в низовьях реки Амударья. 33