1. Левобережная - это система канала Суенли, коллектора ККС, оз.
Судочье и залив Аджибай.
2. Приамударьинская - это приморские 
и 
внутри дельтовые озера,
питающиеся из реки Амударьи и крупных оросительных каналов.
3. Правобережная зона - система канала Кызкеткен, коллекторов КС-1,
КС-3, КС-4, оз. Каратерен.
Первая зона, это зона питания озер на базе коллекторного стока (ККС и
Устьюртский коллектор), на сегодняшний день относится к неблагоприятной
зоне для дальнейшего освоения. В будущем в связи со снижением водности
реки Амударьи ниже Тахиаташского гидроузла подача воды в эту зону
через канал Раушан практически невозможна. Главной задачей данной зоны
является сохранение оз. Судочье, как природного объекта, и цепи озер
системы Кывсыр. В перспективе для сохранения оз. Судочье необходимо
предусмотреть лимит амударьинской воды из концевой части канала Суенли.
Наиболее перспективной является Приамударьинская зона. При попуске
гарантированного стока через Тахиаташский гидроузел будет создана более
или менее благоприятная экологическая и гидрологическая обстановка по
всей длине русла реки от Тахиаташского гидроузла до Аральского моря.
Здесь на Междуречье можно создать крупную регулирующую емкость,
которая даст возможность восстановления продуктивного рыбоводства,
ондатроводства и отгонного животноводства. Это зависит от того, как
будет осуществляться подача воды через Тахиаташский гидроузел в дельту.
Третья зона - Правобережная. 
Положение в этом регионе зависит от
водности года и расходов воды канала Кызкеткен. В этой зоне имеются
многочисленные озера местного назначения, существующие как на пресной,
так и на коллекторной воде (озера: Кокчиел, Каратерен, Дауткуль, Атакуль,
Маукул и ряд других).
Решение 
вопроса 
сохранения 
этих 
озер, 
улучшение 
экологической
обстановки и повышение продуктивности в этом регионе зависит от
наличия воды и ее качества, в основном от объема амударьинской воды. В
многоводные годы, как 1991, 1992, 1993, 1994 гг. в результате поступления
большого объема речной воды в дельту реки Амударьи через русло реки
и 
концевую 
часть 
ирригационных 
каналов, 
состояние 
этих 
озер
значительно улучшилось (особенно в Приамударьинской зоне) и даже
привело к увеличению их площадей.
Для анализа и оценки современного состояния этих озер были использованы
космические снимки при полном (1992 г.), минимальном (2001 г.) и среднем их
наполнений. По данным этих материалов были установлены площади всех
озерных систем в отдельности в годы различной обеспеченности. Также были
определены 
площади 
открытой 
водной 
поверхности 
и 
площади 
водной
82